| 百位 | 列車番号 | 種別 | 運転区間など | 備 考 |
|---|
| ０ | 1D・2D | 特急 | 「おおぞら」函館～旭川/釧路 | 室蘭本線・千歳線経由、滝川～釧路：2001D・2002D |
| 3D・4D | 特急 | 「おおとり」函館～網走/釧路 | 室蘭本線・千歳線経由、滝川～釧路：2003D・2004D |
| 11D・12D | 急行 | 「ライラック」函館～札幌 | |
| 15D・16D | 急行 | 「アカシヤ」函館～札幌 | 室蘭本線・千歳線経由。青函連絡船接続なし |
| 17・18 | 急行 | 「まりも」函館～釧路 | |
| 19D・20D | 急行 | 「すずらん」函館～札幌 | 室蘭本線・千歳線経由
20D 札幌→苫小牧：準急「えりも」（札幌～様似）を併結 |
| １ | 109・110 | 準急 | 「たるまえ」函館～札幌 | 室蘭本線・千歳線経由 |
| 121～ | 普通 | 函館本線の普通列車（青函局～札幌局・旭川局、青函局内列車） | |
| ２ | 211～ | 普通 | 室蘭本線の客車列車 | 別に指定する列車を除く |
| 231～ | 普通 | 室蘭本線 函館・長万部～室蘭の客車列車 | |
| ３ | 303D・304D | 急行 | 「宗谷」函館～稚内 | |
| ４ | 419・420 | 普通 | 函館～釧路 | |
| ５ | 538D～ | 普通 | 室蘭本線 長万部～室蘭間相互発着の気動車列車 | 室蘭～東室蘭を除く |
| ６ | 611D～ | 普通 | 函館本線 長万部地区の区間運転列車（長万部～熱郛・黒松内） | |
| 621D～ | 普通 | 函館本線 函館～長万部間相互発着の気動車列車（駒ヶ岳経由） | |
| 641D～ | 普通 | 函館本線 函館～長万部間相互発着の気動車列車（渡島砂原経由） | |
| ７ | 705D～710D | 準急 | 「おくしり」「えさし」「ひやま」函館～江差 | 707D・708D 函館～木古内：準急「松前」（函館～松前）を併結 |
| 717・718 | 普通 | 江差線 函館～木古内の客車列車 | |
| 741・742 | 普通 | 江差線 函館～上磯の客車列車 | |
| 721D～ | 普通 | 江差線の気動車列車 | 別に指定する列車を除く |
| 743D～ | 普通 | 江差線 木古内・江差地区の区間運転気動車列車 | |
| 751D～ | 普通 | 江差線 函館地区の区間運転気動車列車（函館～上磯） | |
| ８ | 807D・808D | 準急 | 「松前」（函館～）木古内～松前 | 函館～木古内：707D・708Dに併結 |
| 820D～ | 普通 | 松前線の普通列車（函館直通列車） | 函館～木古内：江差線列車と併結する列車あり |
| 840D～ | 普通 | 松前線の普通列車（線内運転） | 821D（木古内0523→松前0646）を除く |
| ９ | 920D～ | 普通 | 瀬棚線の普通列車 | |